16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3891 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3891  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  807    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106321  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1137  hypothetical protein  80.77 
 
 		 444 aa  627  1e-179  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0252196  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0242  hypothetical protein  77.13 
 
 		 400 aa  614  1e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1793  hypothetical protein  51.84 
 
 		 391 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0265229 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2424  hypothetical protein  52.11 
 
 		 391 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.481208  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3274  HAD family hydrolase  33.5 
 
 		 698 aa  187  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258602  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1828  glycogen debranching protein  31.7 
 
 		 458 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2516  glycogen debranching enzyme-like protein  30.88 
 
 		 445 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1537  hypothetical protein  26.49 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.522426  normal  0.175013 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01235  hypothetical protein  22.44 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1522  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.5 
 
 		 565 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.644798 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0707  neutral invertase  31.76 
 
 		 474 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3299  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2313  neutral invertase  28.47 
 
 		 465 aa  50.4  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  24.05 
 
 		 681 aa  47.4  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.866543 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0226  neutral invertase  27.49 
 
 		 492 aa  45.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4305  glycogen debranching enzyme  23.77 
 
 		 674 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.398353  normal  0.279428 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>