43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0164 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0164  membrane protein  100 
 
 		 244 aa  473  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.634614  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1220  hypothetical protein  81.97 
 
 		 244 aa  397  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.210254 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1953  hypothetical protein  75.95 
 
 		 245 aa  355  5e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1826  hypothetical protein  74.9 
 
 		 244 aa  332  4e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.299788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1591  hypothetical protein  74.49 
 
 		 244 aa  331  8e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2271  hypothetical protein  72.31 
 
 		 245 aa  330  1e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00372269  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1497  hypothetical protein  73.44 
 
 		 244 aa  330  1e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2762  hypothetical protein  72.84 
 
 		 244 aa  325  5e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  normal  0.055304 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3684  hypothetical protein  72.37 
 
 		 248 aa  299  3e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3466  hypothetical protein  49.38 
 
 		 495 aa  242  5e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0165  membrane protein  48.85 
 
 		 261 aa  221  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0802  protein of unknown function DUF1538  49.79 
 
 		 503 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1592  hypothetical protein  47.29 
 
 		 261 aa  215  5e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0659  hypothetical protein  49.79 
 
 		 503 aa  212  4.9999999999999996e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201808 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1088  protein of unknown function DUF1538  50.65 
 
 		 506 aa  211  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1952  hypothetical protein  47.47 
 
 		 278 aa  211  7e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1827  hypothetical protein  48.15 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.149521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2761  hypothetical protein  47.74 
 
 		 263 aa  204  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.0518932 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2272  hypothetical protein  45.24 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000140028  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1498  hypothetical protein  45.53 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.660987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3685  hypothetical protein  44.79 
 
 		 269 aa  191  7e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3479  hypothetical protein  43.16 
 
 		 245 aa  189  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405509 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1221  ABC transporter for copper permease protein  49.17 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.121957 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0800  protein of unknown function DUF1538  43.21 
 
 		 497 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0342  protein of unknown function DUF1538  35.42 
 
 		 253 aa  141  8e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510639 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0745  hypothetical protein  38.02 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189103  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3139  membrane spanning protein  38.11 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3478  hypothetical protein  37.55 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611874 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0341  protein of unknown function DUF1538  34.8 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766414 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0101  hypothetical protein  36.55 
 
 		 601 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0474  hypothetical protein  32.33 
 
 		 245 aa  120  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0475  hypothetical protein  33.2 
 
 		 230 aa  118  7.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0337  hypothetical protein  34.78 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0876004  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0338  hypothetical protein  33.79 
 
 		 246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322383  normal  0.567105 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0746  hypothetical protein  32.02 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0127316  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0908  protein of unknown function DUF1538  32.92 
 
 		 507 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0017  hypothetical protein  33.62 
 
 		 620 aa  106  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000261883  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2378  hypothetical protein  32.93 
 
 		 646 aa  102  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2615  hypothetical protein  29.39 
 
 		 508 aa  95.9  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0107308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1143  protein of unknown function DUF1538  31.12 
 
 		 497 aa  92  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150487  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1786  protein of unknown function DUF1538  33.84 
 
 		 545 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0836999  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0323  hypothetical protein  32.41 
 
 		 481 aa  85.5  8e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0750362  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1723  protein of unknown function DUF1538  31.96 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>