38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01976 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01976  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  328  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1403  bacteriophage lysis protein  45.05 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000130995 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1066  bacteriophage lysis protein  45.05 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000488797 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00508  predicted murein endopeptidase  31.33 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00514  hypothetical protein  31.33 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1138  bacteriophage lysis protein  43.96 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10031  cell lysis protein  30.46 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.025296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00729  hypothetical protein  30.46 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0229368  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1614  bacteriophage lysis protein  41.57 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224125 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3073  Phosphoprotein phosphatase  41.57 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1184  bacteriophage lysis protein  32.69 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00247125  hitchhiker  0.0000000000330558 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0942  bacteriophage lysis protein  34.51 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01338  predicted defective peptidase  41.11 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.604576  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01348  hypothetical protein  41.11 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.512118  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3140  bacteriophage lysis protein  37.5 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000519306 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2251  bacteriophage lysis protein  37.5 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000357179 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1859  bacteriophage lysis protein  38.68 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000827785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3207  bacteriophage lysis protein  38.68 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0122029 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0395  bacteriophage lysis protein  41.76 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.328386  hitchhiker  0.00000000000000531683 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1172  bacteriophage lysis protein  32.64 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.583234 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0828  bacteriophage lysis protein  41.76 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1777  bacteriophage lysis protein  34.82 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.0335187 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2783  bacteriophage lysis protein  31.25 
 
 		 155 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1273  bacteriophage lysis protein  38.46 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1451  bacteriophage lysis protein  40.66 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0305  bacteriophage lysis protein  40.66 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2899  bacteriophage lysis protein  39.56 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000634964 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1532  bacteriophage lysis protein  33.96 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3523  bacteriophage lysis protein  37.78 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.328283  hitchhiker  0.000434351 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1152  bacteriophage lysis protein  40.66 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142023  hitchhiker  0.0000000000000115024 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0893  bacteriophage lysis protein  29.75 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2181  bacteriophage lysis protein  32.08 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.225505 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2247  bacteriophage lysis protein  36.96 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.727629  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2818  bacteriophage lysis protein  38.71 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.570005  normal  0.122766 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2608  bacteriophage lysis protein  34.44 
 
 		 153 aa  50.8  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.048327  normal  0.0317443 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0632  bacteriophage lysis protein  35.87 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000814148  normal  0.106962 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5064  bacteriophage lysis protein  32.94 
 
 		 161 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121929  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0692  bacteriophage lysis protein  32.94 
 
 		 161 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>