29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2610 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2610  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  517  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0106  hypothetical protein  62.7 
 
 		 240 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105806 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3892  hypothetical protein  60.74 
 
 		 242 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4096  hypothetical protein  60.25 
 
 		 242 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541182 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1800  capsular polysaccharide biosynthesis protein  48.33 
 
 		 243 aa  224  7e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.6322  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0302  capsular polysaccharide biosynthesis protein  45.8 
 
 		 243 aa  217  2e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.04779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1663  hypothetical protein  37.86 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0423  hypothetical protein  36.44 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0732  hypothetical protein  34.54 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2464  nucleotidyl transferase  31.33 
 
 		 504 aa  105  9e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2595  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.69 
 
 		 494 aa  86.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334164  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0612  nucleotidyl transferase  28.96 
 
 		 253 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0706  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  28.96 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0349  nucleotidyl transferase  24.26 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.309599  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0347  nucleotidyl transferase  25 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0798326  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0308  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  23.89 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.684825  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1806  putative nucleotidyltransferase  26.79 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.716393  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1803  dTDP-glucose pyrophosphorylase  25.3 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0305  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  26.15 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.297803  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  26.13 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14021  hypothetical protein  25.19 
 
 		 529 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0615  hypothetical protein  24.11 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2751  hypothetical protein  24.15 
 
 		 267 aa  52.4  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1996  hypothetical protein  20.62 
 
 		 548 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0665457 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0276  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  21.88 
 
 		 331 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00854948  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  27.03 
 
 		 400 aa  46.2  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0709  hypothetical protein  23.29 
 
 		 240 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  24.89 
 
 		 400 aa  42.7  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  26.24 
 
 		 400 aa  42  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>