18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_R0058 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_R0058  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0051  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.524822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0023  tRNA-Tyr  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000432297  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0020  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000168001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0051  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0589159  unclonable  6.439e-24 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0022  tRNA-Tyr  93.94 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0256241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0052  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.717648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0010  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000653583  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0003  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00106012  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0016  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.190715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0050  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563652  normal  0.998749 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0004  tRNA-Tyr  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000171597  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0027  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.645758  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0015  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0049  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt04  tRNA-Tyr  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt04  tRNA-Tyr  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>