13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2318 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2318  hypothetical protein  100 
 
 
663 aa  1357    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5676  hypothetical protein  34.5 
 
 
683 aa  361  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497659  normal  0.0593404 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5142  hypothetical protein  35.4 
 
 
690 aa  356  6.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0964309  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5083  hypothetical protein  22.93 
 
 
715 aa  75.5  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.365257  normal  0.435002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4556  hypothetical protein  21.67 
 
 
676 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000198635  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1552  hypothetical protein  24.34 
 
 
718 aa  60.8  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.948257  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4442  hypothetical protein  31.67 
 
 
685 aa  52.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118035  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2147  hypothetical protein  30.58 
 
 
682 aa  52.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0780  hypothetical protein  23.56 
 
 
638 aa  49.3  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.27648  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0557  hypothetical protein  28.28 
 
 
675 aa  48.9  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.60887 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  22.84 
 
 
435 aa  44.3  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  23.49 
 
 
435 aa  44.3  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4403  protein of unknown function DUF187  26.09 
 
 
383 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal  0.600099 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>