17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0920 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0942  radical SAM domain-containing protein  99.6 
 
 		 249 aa  506  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0920  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 249 aa  508  1e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0171174  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1700  radical SAM domain-containing protein  51.22 
 
 		 252 aa  260  1e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1142  biotin synthetase-like protein  47.37 
 
 		 253 aa  228  8e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.918331  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1948  radical SAM domain-containing protein  40.07 
 
 		 288 aa  185  7e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1054  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 323 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.910454  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1519  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.95 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0647  Radical SAM domain protein  30.26 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0446  radical SAM family protein  32.35 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1071  Radical SAM domain protein  29.06 
 
 		 332 aa  93.6  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000639337  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1559  radical SAM domain-containing protein  29.73 
 
 		 299 aa  91.3  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0415302 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2087  Radical SAM domain protein  25.94 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1507  radical SAM domain-containing protein  28.77 
 
 		 280 aa  85.9  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0641  Radical SAM domain protein  26.5 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.071148 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2207  radical SAM domain protein  24.45 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2546  radical SAM domain protein  25.33 
 
 		 377 aa  65.9  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2174  Radical SAM domain protein  25.33 
 
 		 373 aa  65.9  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000664459 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>