14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0122 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0122  O-antigen polymerase  100 
 
 		 1065 aa  2158    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0446  O-antigen polymerase  39.41 
 
 		 1070 aa  730    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0515  O-antigen polymerase  37.2 
 
 		 1090 aa  680    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0340666  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0120  O-antigen polymerase  95.96 
 
 		 1065 aa  2058    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0198  O-antigen polymerase  29.73 
 
 		 874 aa  332  2e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1186  Tetratricopeptide domain protein  25.07 
 
 		 829 aa  62  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0301041  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  22.6 
 
 		 773 aa  58.2  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  24.76 
 
 		 612 aa  55.8  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  26.56 
 
 		 437 aa  48.1  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2694  O-antigen polymerase  26.47 
 
 		 535 aa  47.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.247958  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  21.28 
 
 		 870 aa  45.8  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1173  hypothetical protein  23.41 
 
 		 457 aa  45.8  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00922176  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  23.48 
 
 		 754 aa  45.4  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0127  hypothetical protein  22.6 
 
 		 845 aa  45.1  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>