10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1474 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1474  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 243 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.168622  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0173  ABC-2 type transporter  36.32 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00869778  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1969  ABC-2 type transporter  29.08 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000398406  hitchhiker  0.000000000710377 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1079  ABC-2 type transporter  30.21 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0486058 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2151  ABC-2 type transport system, membrane protein  29.95 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.148287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0220  ABC-2 type transport system, membrane protein  29.76 
 
 		 241 aa  52.4  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0612371 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0908  conserved hypothetical protein  24.86 
 
 		 249 aa  50.4  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000484468  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0349  hypothetical protein  22.45 
 
 		 240 aa  45.8  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.13 
 
 		 255 aa  42.7  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  28.99 
 
 		 257 aa  42  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>