14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1132 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1132  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 114 aa  219  9e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0336  DNA polymerase beta domain protein region  42.73 
 
 		 122 aa  87.4  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.712682  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2455  DNA polymerase beta domain protein region  37.23 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.347866  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0251  DNA polymerase beta subunit  41.84 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0736042  normal  0.344396 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0681  DNA polymerase beta subunit  58.82 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.784875  normal  0.848355 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1067  DNA polymerase beta subunit  41.86 
 
 		 108 aa  57  0.00000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.485724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1028  DNA polymerase beta subunit  40.28 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.261092  normal  0.357302 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1318  hypothetical protein  50.88 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.923593 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1697  DNA polymerase beta subunit  39.74 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000599045  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1536  hypothetical protein  41.1 
 
 		 81 aa  45.1  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.851535  normal  0.0721656 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1686  DNA polymerase beta subunit  45.76 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000153026  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0102  nucleotidyltransferase domain-containing protein  40.54 
 
 		 128 aa  40  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0913883  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0063  nucleotidyltransferase domain protein  40.54 
 
 		 128 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0040  nucleotidyltransferase domain protein  40.54 
 
 		 128 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000549944 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>