18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0460 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0460  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  344  3e-94  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0669  hypothetical protein  34.67 
 
 
204 aa  51.2  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.239778  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0731  hypothetical protein  33.33 
 
 
198 aa  49.7  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.336545  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0918  protein of unknown function DUF358  26.19 
 
 
189 aa  49.3  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000434231  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1731  hypothetical protein  33.33 
 
 
198 aa  48.9  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0907  hypothetical protein  33.33 
 
 
202 aa  49.3  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000169556  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0171  hypothetical protein  33.33 
 
 
198 aa  48.9  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.190358  normal  0.933799 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0217  hypothetical protein  30.67 
 
 
198 aa  47  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.638507  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1447  hypothetical protein  32.5 
 
 
199 aa  46.2  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353847  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0609  hypothetical protein  41.27 
 
 
196 aa  45.4  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1876  hypothetical protein  32.95 
 
 
191 aa  44.7  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.205093 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1963  hypothetical protein  40.98 
 
 
189 aa  44.3  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3229  hypothetical protein  35.48 
 
 
211 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000502715  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0545  hypothetical protein  32.79 
 
 
191 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0274885  normal  0.338347 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1588  hypothetical protein  42.31 
 
 
207 aa  43.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00408937 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3024  hypothetical protein  35.62 
 
 
194 aa  42.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0735  protein of unknown function DUF358  34.23 
 
 
199 aa  42.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1566  hypothetical protein  25 
 
 
195 aa  40.8  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.675454  hitchhiker  0.00439427 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>