31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4291 on replicon NC_014159
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014159  Tpau_4291  hypothetical protein  100 
 
 		 483 aa  969    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.814822  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2537  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  26.9 
 
 		 1072 aa  117  3.9999999999999997e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1163  hypothetical protein  27.7 
 
 		 742 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11418  hypothetical protein  25.47 
 
 		 580 aa  71.2  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227142  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03600  hypothetical protein  30 
 
 		 651 aa  68.6  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2959  hypothetical protein  28.12 
 
 		 551 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0119375  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  27.67 
 
 		 507 aa  62.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2744  hypothetical protein  27.03 
 
 		 580 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0706789  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3130  hypothetical protein  23.14 
 
 		 572 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2356  hypothetical protein  24.06 
 
 		 578 aa  55.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2071  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  25.4 
 
 		 616 aa  55.1  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11200  hypothetical protein  27.25 
 
 		 593 aa  53.9  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1205  hypothetical protein  26.85 
 
 		 593 aa  53.5  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4373  hypothetical protein  22.71 
 
 		 633 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.32896e-21 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 485 aa  53.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  26.09 
 
 		 499 aa  53.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1859  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  19.46 
 
 		 623 aa  50.1  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1824  hypothetical protein  25.79 
 
 		 582 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000311233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0823  hypothetical protein  26.18 
 
 		 651 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.95 
 
 		 481 aa  48.5  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  25.77 
 
 		 490 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3018  hypothetical protein  28.68 
 
 		 603 aa  47.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0249937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1458  putative lipoprotein  26.37 
 
 		 624 aa  47  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.342191  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  28.21 
 
 		 442 aa  47  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0676  hypothetical protein  25.24 
 
 		 659 aa  45.8  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758616  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6222  hypothetical protein  27.24 
 
 		 619 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.690917  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17770  hypothetical protein  27.27 
 
 		 644 aa  45.4  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413089  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  28.29 
 
 		 445 aa  43.9  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  34.74 
 
 		 464 aa  43.9  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  31.9 
 
 		 480 aa  43.9  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0893  hypothetical protein  24.21 
 
 		 446 aa  43.1  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>