54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3188 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3188  Triacylglycerol lipase  100 
 
 
464 aa  934    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0920741  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01799  secretory lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00110)  33.56 
 
 
450 aa  244  3e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0803381  normal  0.696532 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3087  triacylglycerol lipase  35.44 
 
 
450 aa  232  9e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3070  triacylglycerol lipase  35.44 
 
 
450 aa  232  9e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3130  triacylglycerol lipase  35.44 
 
 
450 aa  232  9e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.648254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3621  triacylglycerol lipase  34.38 
 
 
450 aa  226  8e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120078  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2796  triacylglycerol lipase  33.83 
 
 
450 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.604768  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11608  hypothetical protein  36.93 
 
 
446 aa  224  3e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.166185  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0186  Triacylglycerol lipase  32.98 
 
 
481 aa  217  2.9999999999999998e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0411  triacylglycerol lipase  35.57 
 
 
447 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.542327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0424  triacylglycerol lipase  35.57 
 
 
447 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0434  triacylglycerol lipase  35.57 
 
 
447 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.601093  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0048  Triacylglycerol lipase  32.64 
 
 
432 aa  196  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28952  predicted protein  31.03 
 
 
482 aa  195  1e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0716767  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06773  conserved hypothetical protein  34.07 
 
 
448 aa  177  4e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355363  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0321  Triacylglycerol lipase  29 
 
 
444 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0760  secretory lipase  29.63 
 
 
468 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1374  triacylglycerol lipase  26.44 
 
 
433 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141016  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38210  acetyl esterase (deacetylase)  27.09 
 
 
415 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.579943  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1356  triacylglycerol lipase  26.32 
 
 
433 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1338  triacylglycerol lipase  26.32 
 
 
433 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0759  secretory lipase  27.56 
 
 
470 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1122  Triacylglycerol lipase  31.38 
 
 
444 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4826  Triacylglycerol lipase  25.81 
 
 
392 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2046  secretory lipase  35.15 
 
 
505 aa  99.8  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02050  Secretory lipase  27.02 
 
 
451 aa  98.6  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0085  triacylglycerol lipase  27.11 
 
 
438 aa  98.2  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0814  secretory lipase  25.98 
 
 
444 aa  97.1  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4620  triacylglycerol lipase  27.38 
 
 
440 aa  96.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102768 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5608  triacylglycerol lipase  27.15 
 
 
440 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.440083 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5251  triacylglycerol lipase  27.15 
 
 
440 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0465  secretory lipase  26.06 
 
 
439 aa  89.7  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3126  secretory lipase  28.23 
 
 
406 aa  85.9  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0242733  normal  0.0408746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0388  Triacylglycerol lipase  24.57 
 
 
422 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0030  secretory lipase  26.18 
 
 
442 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1425  secretory lipase  22.52 
 
 
417 aa  58.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283647  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0016  secretory lipase  26.55 
 
 
367 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1063  secretory lipase  23.77 
 
 
409 aa  57.4  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.108571  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0329  secretory lipase  24.73 
 
 
417 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.282596 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0883  secretory lipase family protein  24.04 
 
 
377 aa  53.1  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.644932  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1850  secretory lipase family protein  24.04 
 
 
377 aa  53.1  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0585  secretory lipase family protein  24.04 
 
 
426 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566733  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2321  secretory lipase family protein  24.01 
 
 
410 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65291  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1013  putative secretory lipase  24.01 
 
 
410 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1100  putative secretory lipase  24.01 
 
 
410 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3251  hypothetical protein  24.47 
 
 
402 aa  51.2  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.18778 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3821  secretory lipase  25.85 
 
 
420 aa  50.1  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0583502  normal  0.737344 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0393  secretory lipase  28.66 
 
 
386 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0972  secretory lipase  26.95 
 
 
375 aa  47  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441802  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3161  hypothetical protein  25.15 
 
 
400 aa  47  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0474  secretory lipase  26.37 
 
 
376 aa  44.7  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0584  secretory lipase  21.82 
 
 
413 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1520  secretory lipase  24.17 
 
 
376 aa  44.3  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0763  hypothetical protein  25.95 
 
 
398 aa  43.5  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527561  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>