16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3115 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3115  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  402  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0571387  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2078  hypothetical protein  39.27 
 
 
201 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0179834  normal  0.111203 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4632  hypothetical protein  40.57 
 
 
193 aa  125  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.242724  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1679  hypothetical protein  35.95 
 
 
229 aa  125  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11131  hypothetical protein  39.3 
 
 
212 aa  124  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4106  hypothetical protein  40.48 
 
 
184 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4182  hypothetical protein  40.48 
 
 
184 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126083  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4337  hypothetical protein  40.48 
 
 
184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.159119 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31490  hypothetical protein  36.27 
 
 
186 aa  98.2  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.265456  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0728  hypothetical protein  33.79 
 
 
209 aa  85.5  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4388  hypothetical protein  33.75 
 
 
329 aa  54.7  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1090  hypothetical protein  42.65 
 
 
231 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.224449  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1007  hypothetical protein  46.81 
 
 
519 aa  48.5  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.299981  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3150  hypothetical protein  47.83 
 
 
78 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0235475  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3736  hypothetical protein  43.33 
 
 
111 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139071  hitchhiker  0.0052659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8481  hypothetical protein  40.43 
 
 
386 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>