45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2812 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2812  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 149 aa  303  4.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0847205  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2811  cyclase/dehydrase  59.73 
 
 		 150 aa  181  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0739801  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0728  cyclase/dehydrase  37.16 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4499  cyclase/dehydrase  41.22 
 
 		 146 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4586  cyclase/dehydrase  41.22 
 
 		 146 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4882  cyclase/dehydrase  41.22 
 
 		 146 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10871  hypothetical protein  41.1 
 
 		 147 aa  103  8e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253989 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5072  cyclase/dehydrase  37.76 
 
 		 146 aa  100  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0509  cyclase/dehydrase  40.14 
 
 		 145 aa  100  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1679  cyclase/dehydrase  33.57 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.846204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4501  cyclase/dehydrase  38.26 
 
 		 148 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4588  cyclase/dehydrase  38.26 
 
 		 148 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4884  cyclase/dehydrase  38.26 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5073  cyclase/dehydrase  36.11 
 
 		 156 aa  92  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.053477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4883  cyclase/dehydrase  34.72 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0833406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4500  cyclase/dehydrase  34.72 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4587  cyclase/dehydrase  34.72 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4498  cyclase/dehydrase  35.14 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4585  cyclase/dehydrase  35.14 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4881  cyclase/dehydrase  35.14 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1678  cyclase/dehydrase  34.03 
 
 		 146 aa  84  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10874  hypothetical protein  30.14 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0259226 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5071  cyclase/dehydrase  31.72 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0938  cyclase/dehydrase  31.3 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.567828  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1386  cyclase/dehydrase  29.17 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.339684  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10873  hypothetical protein  28.8 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.034604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2698  hypothetical protein  28.67 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3112  cyclase/dehydrase  30.83 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1822  cyclase/dehydrase  26.72 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3095  cyclase/dehydrase  25.93 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2698  cyclase/dehydrase  27.59 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0875708  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4867  cyclase/dehydrase  26.87 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2678  Polyketide cyclase/dehydrase  26.24 
 
 		 153 aa  52.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.368637  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3049  cyclase/dehydrase  24.64 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00119371  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24890  polyketide cyclase / dehydrase family protein  26.53 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6066  cyclase/dehydrase  27.41 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3233  cyclase/dehydrase  29.17 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3329  cyclase/dehydrase  25.17 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12213  hypothetical protein  28.36 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3547  cyclase/dehydrase  26.87 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2964  cyclase/dehydrase  26.39 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1306  cyclase/dehydrase  22.6 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138672  normal  0.43501 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3508  cyclase/dehydrase  25 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3276  cyclase/dehydrase  22.92 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3044  cyclase/dehydrase  28.77 
 
 		 145 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>