55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2678 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2678  Polyketide cyclase/dehydrase  100 
 
 		 153 aa  308  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.368637  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24890  polyketide cyclase / dehydrase family protein  52.08 
 
 		 147 aa  150  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3044  cyclase/dehydrase  52.78 
 
 		 145 aa  150  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1386  cyclase/dehydrase  51.75 
 
 		 144 aa  149  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.339684  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3233  cyclase/dehydrase  51.05 
 
 		 145 aa  147  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3329  cyclase/dehydrase  51.39 
 
 		 144 aa  147  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3276  cyclase/dehydrase  50 
 
 		 147 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4867  cyclase/dehydrase  46.26 
 
 		 152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3547  cyclase/dehydrase  45.52 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2964  cyclase/dehydrase  44.83 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2698  hypothetical protein  48.61 
 
 		 145 aa  125  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3508  cyclase/dehydrase  48.28 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3291  cyclase/dehydrase  46.21 
 
 		 145 aa  120  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.16801 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12213  hypothetical protein  42.36 
 
 		 144 aa  120  7e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3342  cyclase/dehydrase  45.52 
 
 		 145 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330453  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3049  cyclase/dehydrase  45.83 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00119371  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3280  cyclase/dehydrase  45.52 
 
 		 145 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1306  cyclase/dehydrase  46.53 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138672  normal  0.43501 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1822  cyclase/dehydrase  41.26 
 
 		 148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3112  cyclase/dehydrase  42.66 
 
 		 146 aa  110  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6066  cyclase/dehydrase  39.58 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3095  cyclase/dehydrase  37.06 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10871  hypothetical protein  37.78 
 
 		 147 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253989 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1679  cyclase/dehydrase  35.92 
 
 		 146 aa  92  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.846204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10874  hypothetical protein  36.3 
 
 		 157 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0259226 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5072  cyclase/dehydrase  35.21 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0728  cyclase/dehydrase  33.58 
 
 		 146 aa  85.5  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4499  cyclase/dehydrase  37.78 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4586  cyclase/dehydrase  37.78 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4882  cyclase/dehydrase  37.78 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5073  cyclase/dehydrase  30.28 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.053477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0938  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.567828  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4881  cyclase/dehydrase  34.51 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4498  cyclase/dehydrase  33.8 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4585  cyclase/dehydrase  33.8 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1678  cyclase/dehydrase  30.28 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4500  cyclase/dehydrase  29.63 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4587  cyclase/dehydrase  29.63 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4883  cyclase/dehydrase  29.63 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0833406 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4884  cyclase/dehydrase  33.1 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4501  cyclase/dehydrase  33.1 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4588  cyclase/dehydrase  33.1 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0509  cyclase/dehydrase  36.3 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10873  hypothetical protein  29.77 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.034604 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5071  cyclase/dehydrase  30.99 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2812  cyclase/dehydrase  26.24 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0847205  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2307  cyclase/dehydrase  29.82 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812492  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2811  cyclase/dehydrase  24.65 
 
 		 150 aa  47.4  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0739801  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0113  hypothetical protein  23.08 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2219  cyclase/dehydrase  30.43 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16761  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0122  cyclase/dehydrase  23.08 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.367353  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0103  cyclase/dehydrase  23.08 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10165  hypothetical protein  29.36 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1641  cyclase/dehydrase  29.57 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2170  cyclase/dehydrase  27.82 
 
 		 148 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.950805  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>