19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2535 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2535  Limonene-12-epoxide hydrolase  100 
 
 		 147 aa  291  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.253274  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1540  Limonene-12-epoxide hydrolase  43.75 
 
 		 146 aa  124  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2128  limonene-1,2-epoxide hydrolase  46.97 
 
 		 149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2174  limonene-1,2-epoxide hydrolase  46.97 
 
 		 149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191254  normal  0.289892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2115  limonene-1,2-epoxide hydrolase  46.97 
 
 		 149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12753  hypothetical protein  43.31 
 
 		 149 aa  110  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000384763  normal  0.0262942 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3985  limonene-1,2-epoxide hydrolase  41.84 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.174553  normal  0.332359 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3208  Limonene-12-epoxide hydrolase  38.52 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2400  limonene-1,2-epoxide hydrolase  35.43 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113747 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0391  limonene-1,2-epoxide hydrolase  39.2 
 
 		 134 aa  76.6  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82468  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4895  limonene-12-epoxide hydrolase  35.34 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.969382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5375  limonene-1,2-epoxide hydrolase  35.34 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2991  limonene-1,2-epoxide hydrolase  35.34 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2094  limonene-1,2-epoxide hydrolase  31.78 
 
 		 124 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146281 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4611  limonene-1,2-epoxide hydrolase  28.44 
 
 		 124 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1024  limonene-1,2-epoxide hydrolase  36.47 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.903777  normal  0.0576424 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5231  limonene-1,2-epoxide hydrolase  33.04 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.486907 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0811  Limonene-12-epoxide hydrolase  32.61 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0903  limonene-1,2-epoxide hydrolase  30.16 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>