18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2324 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2324  protein of unknown function DUF1396  100 
 
 		 268 aa  533  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11399  lipoprotein lprF  40 
 
 		 261 aa  145  5e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3312  protein of unknown function DUF1396  38.96 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0367  protein of unknown function DUF1396  34.07 
 
 		 243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0720585  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2435  hypothetical protein  35.81 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2429  hypothetical protein  35.81 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2388  hypothetical protein  35.81 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11440  lipoprotein lprG  29.91 
 
 		 236 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3724  hypothetical protein  33.8 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.0746496 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05600  Protein of unknown function (DUF1396)  30.9 
 
 		 227 aa  95.9  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2692  hypothetical protein  33.64 
 
 		 234 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11296  lipoprotein lprA  29.1 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1964  protein of unknown function DUF1396  30.99 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3012  hypothetical protein  26.01 
 
 		 225 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07420  Protein of unknown function (DUF1396)  25.13 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3158  protein of unknown function DUF1396  22.78 
 
 		 230 aa  46.2  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0785355  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1501  hypothetical protein  22.56 
 
 		 218 aa  45.8  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12959  lipoprotein lppX  24.72 
 
 		 233 aa  42.7  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200622  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>