20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0418 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0418  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 
1404 aa  2725    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4462  hypothetical protein  49.97 
 
 
1435 aa  1171    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.8881  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0226  putative transmembrane protein  49.78 
 
 
1384 aa  1098    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0236  putative transmembrane protein  49.78 
 
 
1384 aa  1098    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.635467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0253  putative transmembrane protein  48.07 
 
 
1408 aa  1028    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640181  normal  0.103172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0216  putative transmembrane protein  49.71 
 
 
1384 aa  1088    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0418  putative transmembrane protein  46.21 
 
 
1347 aa  960    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0280672  normal  0.0494361 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10238  transmembrane protein  49.6 
 
 
1400 aa  1030    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0207  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  36.07 
 
 
1435 aa  568  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.608322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0189  hypothetical protein  35.41 
 
 
1435 aa  533  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335759  normal  0.93166 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3706  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.84 
 
 
1506 aa  499  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2998  hypothetical protein  34.59 
 
 
1342 aa  498  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0440986  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3992  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.62 
 
 
1430 aa  486  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.589643  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1471  hypothetical protein  33.05 
 
 
1345 aa  436  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.984073 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2467  hypothetical protein  31.91 
 
 
1403 aa  412  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0805  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  36.74 
 
 
1371 aa  386  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5301  hypothetical protein  34.84 
 
 
1312 aa  372  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.437695  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1165  hypothetical protein  33.74 
 
 
1322 aa  351  5e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368185  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5501  hypothetical protein  26.1 
 
 
1672 aa  132  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.627379  normal  0.180231 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1050  hypothetical protein  26.15 
 
 
1608 aa  130  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>