19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0367 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0367  protein of unknown function DUF1396  100 
 
 
243 aa  487  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0720585  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2388  hypothetical protein  41.47 
 
 
236 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2435  hypothetical protein  41.47 
 
 
236 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2429  hypothetical protein  41.47 
 
 
236 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2692  hypothetical protein  39.73 
 
 
234 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11440  lipoprotein lprG  36.4 
 
 
236 aa  148  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3724  hypothetical protein  40.1 
 
 
256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.0746496 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3312  protein of unknown function DUF1396  35.58 
 
 
262 aa  126  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05600  Protein of unknown function (DUF1396)  35.24 
 
 
227 aa  116  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11296  lipoprotein lprA  30.04 
 
 
244 aa  116  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2324  protein of unknown function DUF1396  36.02 
 
 
268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11399  lipoprotein lprF  31.2 
 
 
261 aa  103  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07420  Protein of unknown function (DUF1396)  28.72 
 
 
234 aa  90.5  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3012  hypothetical protein  30 
 
 
225 aa  89.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218964  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1964  protein of unknown function DUF1396  34.2 
 
 
275 aa  85.5  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12959  lipoprotein lppX  26.67 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200622  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3158  protein of unknown function DUF1396  27.15 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0785355  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1501  hypothetical protein  27.15 
 
 
218 aa  62.4  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268016  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2950  hypothetical protein  22.37 
 
 
232 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.365698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>