13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0280 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0280  paREP1  100 
 
 
273 aa  552  1e-156  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.216208  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1373  paREP1  91.94 
 
 
278 aa  492  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1545  paREP1  49.62 
 
 
280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.972627 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0559  GTP:adenosylcobinamide-phosphate guanylyltransferase-like protein  31.65 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6955  ParB domain protein nuclease  43.18 
 
 
128 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.92637  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1066  nuclease  41.32 
 
 
153 aa  61.2  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1725  nucleoside triphosphate  27.54 
 
 
177 aa  54.3  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1604  nuclease  31.71 
 
 
168 aa  47.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0583  ParB-like nuclease  32.69 
 
 
130 aa  46.2  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000149246  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.02 
 
 
534 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2111  nuclease  38.24 
 
 
193 aa  44.3  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0989  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.57 
 
 
243 aa  42.7  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1581  5-deoxyadenosylcobinamide phosphate nucleotidyltransferase  29.63 
 
 
194 aa  42.4  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>