22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2673 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2673  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2565  hypothetical protein  51.56 
 
 
70 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.382416  normal  0.0961796 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1577  hypothetical protein  53.12 
 
 
70 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303774 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4240  hypothetical protein  46.27 
 
 
69 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2500  hypothetical protein  45.9 
 
 
66 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12560  hypothetical protein  50.91 
 
 
69 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1143  hypothetical protein  50.91 
 
 
69 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784924  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0231  hypothetical protein  50 
 
 
68 aa  53.9  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0008  hypothetical protein  42.86 
 
 
70 aa  52  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.301477  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3030  hypothetical protein  43.48 
 
 
74 aa  50.1  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.299577  normal  0.851885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0643  hypothetical protein  49.09 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0293  hypothetical protein  51.16 
 
 
76 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09950  hypothetical protein  52.27 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.698592  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4653  hypothetical protein  45.45 
 
 
67 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.672863  normal  0.338139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4777  hypothetical protein  45.45 
 
 
67 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.927704  hitchhiker  0.00369137 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4831  hypothetical protein  45.45 
 
 
67 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1054  hypothetical protein  41.79 
 
 
70 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.127693 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4940  hypothetical protein  45.45 
 
 
69 aa  47  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3743  hypothetical protein  51.67 
 
 
72 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.87408 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2240  hypothetical protein  61.29 
 
 
72 aa  43.5  0.0009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.261162 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1947  hypothetical protein  61.29 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2604  hypothetical protein  39.13 
 
 
69 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>