More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1537 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1537  phosphopantetheine-binding  100 
 
 
84 aa  155  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.157391  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0883  acyl carrier protein  62.5 
 
 
82 aa  103  6e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242851  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  50.65 
 
 
81 aa  77.8  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  50.65 
 
 
81 aa  77.8  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0310  acyl carrier protein  44 
 
 
76 aa  72  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00336649  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0401  acyl carrier protein  50 
 
 
79 aa  71.6  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338401  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0408  acyl carrier protein  48.65 
 
 
79 aa  71.2  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.442287  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1053  acyl carrier protein  47.3 
 
 
79 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2262  acyl carrier protein  47.3 
 
 
79 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033873  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2427  acyl carrier protein  47.3 
 
 
79 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0918  acyl carrier protein  47.95 
 
 
79 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.150298  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0983  acyl carrier protein  47.95 
 
 
79 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415355  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  44.44 
 
 
81 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  45.07 
 
 
77 aa  67.8  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  44.59 
 
 
79 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  44.59 
 
 
79 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  44.59 
 
 
79 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  44.59 
 
 
79 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  44.59 
 
 
79 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  44.59 
 
 
79 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  44.59 
 
 
79 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  44.59 
 
 
79 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  44.59 
 
 
79 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  44.59 
 
 
79 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  44.59 
 
 
79 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  46.15 
 
 
74 aa  67.8  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  44.59 
 
 
79 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  44.59 
 
 
79 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  44.59 
 
 
79 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  44.59 
 
 
79 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  44.59 
 
 
79 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  44.59 
 
 
79 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  44.59 
 
 
79 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1011  acyl carrier protein  43.75 
 
 
85 aa  67.4  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303772  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  45.95 
 
 
82 aa  67  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  45.21 
 
 
78 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  48.61 
 
 
78 aa  66.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1610  Acyl carrier protein (ACP)  44.74 
 
 
90 aa  65.5  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  43.59 
 
 
80 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  45.21 
 
 
79 aa  64.7  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  45.45 
 
 
79 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1602  acyl carrier protein  47.76 
 
 
77 aa  64.7  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00127335  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  44.29 
 
 
78 aa  63.9  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  45.83 
 
 
78 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0750  phosphopantetheine-binding  43.04 
 
 
93 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0676066  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  41.03 
 
 
80 aa  62.8  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1504  acyl carrier protein  43.84 
 
 
78 aa  63.2  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0070299  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0608  acyl carrier protein  45.21 
 
 
79 aa  63.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000394559 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  43.84 
 
 
77 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1258  acyl carrier protein  44.44 
 
 
79 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  45.83 
 
 
78 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  42.5 
 
 
77 aa  63.2  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  45.83 
 
 
78 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02218  acyl-carrier-protein  35.37 
 
 
87 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  43.84 
 
 
79 aa  62  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  47.06 
 
 
78 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  42.47 
 
 
79 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1587  acyl carrier protein  43.06 
 
 
79 aa  62.8  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281743  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  45.59 
 
 
78 aa  62.4  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  43.84 
 
 
79 aa  62  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  43.84 
 
 
79 aa  62  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2083  acyl carrier protein  47.89 
 
 
76 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000417197  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  43.84 
 
 
79 aa  62  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1644  acyl carrier protein  43.06 
 
 
79 aa  62.8  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.28963  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  42.47 
 
 
79 aa  62  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  47.06 
 
 
78 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  47.76 
 
 
77 aa  62  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  39.24 
 
 
83 aa  61.6  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  44.78 
 
 
78 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  45.83 
 
 
79 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3483  acyl carrier protein  46.05 
 
 
79 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.057924  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  43.59 
 
 
80 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2133  acyl carrier protein  52.46 
 
 
77 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000639035  normal  0.0269953 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1687  acyl carrier protein  46.05 
 
 
79 aa  62  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  43.84 
 
 
79 aa  62  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  43.84 
 
 
79 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  43.59 
 
 
80 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0458  acyl carrier protein  41.77 
 
 
80 aa  61.6  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.89611  normal  0.887307 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  43.84 
 
 
79 aa  61.6  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  44.78 
 
 
78 aa  61.6  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2978  acyl carrier protein  46.05 
 
 
79 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.702686  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  47.76 
 
 
75 aa  61.6  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  46.58 
 
 
78 aa  61.6  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1216  acyl carrier protein  45.33 
 
 
78 aa  62  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.686684 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1351  acyl carrier protein  44 
 
 
82 aa  61.6  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1347  acyl carrier protein  44 
 
 
82 aa  61.6  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1548  Acyl carrier protein (ACP)  44.93 
 
 
77 aa  61.2  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.079585  normal  0.066745 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  45.07 
 
 
78 aa  61.6  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  43.84 
 
 
79 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  43.84 
 
 
79 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2736  acyl carrier protein  41.25 
 
 
80 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.875192  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0773  phosphopantetheine-binding  40.51 
 
 
93 aa  61.2  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.149399  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  46.27 
 
 
77 aa  61.2  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  46.27 
 
 
77 aa  61.2  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3132  acyl carrier protein  45.83 
 
 
78 aa  60.8  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  46.27 
 
 
77 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000614435  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2572  acyl carrier protein  46.27 
 
 
77 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000656295  hitchhiker  0.00274043 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  42.47 
 
 
79 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1720  acyl carrier protein  46.27 
 
 
77 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138911  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  44.78 
 
 
78 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>