14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1092 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1092  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  153  8e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1487  hypothetical protein  49.18 
 
 
69 aa  64.7  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0550  hypothetical protein  43.75 
 
 
74 aa  59.7  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129436  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2918  hypothetical protein  37.7 
 
 
75 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4786  hypothetical protein  32.79 
 
 
66 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1147  hypothetical protein  40.62 
 
 
79 aa  51.6  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.62198  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4662  hypothetical protein  37.7 
 
 
74 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.2161  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1158  hypothetical protein  33.85 
 
 
73 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00402428  hitchhiker  0.0000171721 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3239  hypothetical protein  31.75 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1825  hypothetical protein  31.58 
 
 
73 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0426  hypothetical protein  34.92 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0055  hypothetical protein  30.65 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2547  hypothetical protein  40 
 
 
77 aa  41.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5597  hypothetical protein  32.43 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>