13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1066 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1066  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  746    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.171823  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0299  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 		 387 aa  185  9e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0363  glycosyl transferase, group 1  37.22 
 
 		 383 aa  169  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0389  hypothetical protein  42.13 
 
 		 244 aa  143  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380665  normal  0.0164926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  22.33 
 
 		 390 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  22.01 
 
 		 390 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02010  glycosyltransferase  21.79 
 
 		 389 aa  53.1  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.472903  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  20.81 
 
 		 386 aa  52.8  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  22.51 
 
 		 423 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  24.39 
 
 		 445 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  22.89 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  24.64 
 
 		 412 aa  43.5  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3791  glycosyl transferase, group 1  26.23 
 
 		 428 aa  43.1  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>