16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0599 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0599  abortive infection protein  100 
 
 
163 aa  316  9e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1544  abortive infection protein  47.71 
 
 
228 aa  111  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000980849  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0787  Abortive infection protein  30.61 
 
 
257 aa  51.2  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0376  Abortive infection protein  35.29 
 
 
246 aa  48.9  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0452979  normal  0.970349 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2684  Abortive infection protein  25.4 
 
 
257 aa  48.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0151  Abortive infection protein  27.37 
 
 
276 aa  47.4  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2572  Abortive infection protein  28.04 
 
 
251 aa  46.6  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.610355  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0752  Abortive infection protein  28.12 
 
 
374 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2712  Abortive infection protein  27.72 
 
 
372 aa  44.3  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1870  CAAX amino terminal protease family protein  32 
 
 
278 aa  43.9  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000233024  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2468  Abortive infection protein  26.8 
 
 
317 aa  43.9  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.846386  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0516  membrane associated protease-like  33.68 
 
 
453 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  32.29 
 
 
234 aa  42.4  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0518  hypothetical protein  25.71 
 
 
241 aa  41.2  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.13521 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0359  metal-dependent membrane protease  36.26 
 
 
306 aa  41.2  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1841  CAAX family protease  29.59 
 
 
286 aa  41.2  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>