17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3012 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3012  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  310  6.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.51732  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3048  hypothetical protein  38.03 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244651  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0878  hypothetical protein  32.48 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0204  hypothetical protein  31.37 
 
 		 174 aa  50.8  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.646726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5049  hypothetical protein  33.56 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.223835 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1625  hypothetical protein  27.97 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01123  hypothetical protein  26.95 
 
 		 181 aa  45.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4757  hypothetical protein  31.4 
 
 		 178 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595527  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2292  hypothetical protein  29.08 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3569  hypothetical protein  28.17 
 
 		 168 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.971012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4248  hypothetical protein  32.56 
 
 		 167 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.598118 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0585  hypothetical protein  32.86 
 
 		 173 aa  42  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.294633 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0560  putative membrane protein of unknown function  32.86 
 
 		 173 aa  42  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.261245 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0596  hypothetical protein  32.86 
 
 		 173 aa  42  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.576542 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0663  integral membrane protein-like protein  30.52 
 
 		 169 aa  41.2  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.262552  normal  0.082047 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2847  hypothetical protein  32 
 
 		 165 aa  40.8  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0161  hypothetical protein  26.86 
 
 		 174 aa  40.4  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>