43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0800 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0800  protein of unknown function DUF1538  100 
 
 		 497 aa  946    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0659  hypothetical protein  47.2 
 
 		 503 aa  427  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201808 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1088  protein of unknown function DUF1538  46.72 
 
 		 506 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3466  hypothetical protein  44.67 
 
 		 495 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0802  protein of unknown function DUF1538  46.98 
 
 		 503 aa  401  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1953  hypothetical protein  43.39 
 
 		 245 aa  182  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1220  hypothetical protein  41.49 
 
 		 244 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.210254 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2271  hypothetical protein  41.15 
 
 		 245 aa  170  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00372269  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1591  hypothetical protein  38.27 
 
 		 244 aa  162  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0164  membrane protein  42.8 
 
 		 244 aa  160  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.634614  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1497  hypothetical protein  40.5 
 
 		 244 aa  159  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1826  hypothetical protein  39.75 
 
 		 244 aa  158  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.299788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3684  hypothetical protein  44.74 
 
 		 248 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2762  hypothetical protein  38.37 
 
 		 244 aa  153  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  normal  0.055304 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0165  membrane protein  36.33 
 
 		 261 aa  151  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1952  hypothetical protein  36.8 
 
 		 278 aa  147  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0101  hypothetical protein  30.49 
 
 		 601 aa  145  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3479  hypothetical protein  37.02 
 
 		 245 aa  145  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405509 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0017  hypothetical protein  25.38 
 
 		 620 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000261883  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3685  hypothetical protein  36.48 
 
 		 269 aa  142  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1592  hypothetical protein  35.97 
 
 		 261 aa  137  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2615  hypothetical protein  25.68 
 
 		 508 aa  137  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0107308  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1498  hypothetical protein  36.18 
 
 		 262 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.660987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1143  protein of unknown function DUF1538  27.39 
 
 		 497 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150487  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2761  hypothetical protein  36.02 
 
 		 263 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.0518932 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1827  hypothetical protein  35.78 
 
 		 261 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.149521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2272  hypothetical protein  38.1 
 
 		 255 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000140028  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3478  hypothetical protein  37.92 
 
 		 255 aa  127  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611874 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1221  ABC transporter for copper permease protein  35.51 
 
 		 264 aa  120  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.121957 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0908  protein of unknown function DUF1538  25.21 
 
 		 507 aa  119  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3139  membrane spanning protein  36.75 
 
 		 242 aa  117  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1786  protein of unknown function DUF1538  27.23 
 
 		 545 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0836999  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0745  hypothetical protein  35.16 
 
 		 231 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189103  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0342  protein of unknown function DUF1538  31.84 
 
 		 253 aa  107  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510639 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0746  hypothetical protein  36.12 
 
 		 243 aa  107  6e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0127316  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0323  hypothetical protein  26.62 
 
 		 481 aa  106  9e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0750362  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0341  protein of unknown function DUF1538  30.22 
 
 		 230 aa  106  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0337  hypothetical protein  33.04 
 
 		 232 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0876004  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0475  hypothetical protein  32.47 
 
 		 230 aa  104  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0474  hypothetical protein  30.7 
 
 		 245 aa  93.6  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0338  hypothetical protein  28.89 
 
 		 246 aa  82.4  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322383  normal  0.567105 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2378  hypothetical protein  31.22 
 
 		 646 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1723  protein of unknown function DUF1538  29.35 
 
 		 288 aa  62.8  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>