24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0154 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0154  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  166  8e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.426804  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0264  hypothetical protein  63.75 
 
 
84 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0787  CopG/DNA-binding domain-containing protein  56.96 
 
 
82 aa  90.5  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1008  hypothetical protein  54.88 
 
 
83 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1314  CopG domain protein DNA-binding domain protein  50.62 
 
 
80 aa  82.8  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000153702 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2046  CopG domain protein DNA-binding domain protein  50.63 
 
 
80 aa  80.1  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.30352  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2415  hypothetical protein  50.63 
 
 
80 aa  80.1  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.612018  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1870  hypothetical protein  64.41 
 
 
109 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.530557  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1617  hypothetical protein  43.08 
 
 
70 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.11384  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2757  hypothetical protein  55.26 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0130  hypothetical protein  41.18 
 
 
70 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2196  hypothetical protein  41.18 
 
 
70 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  45.83 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  45.83 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0659  hypothetical protein  43.1 
 
 
72 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4094  hypothetical protein  36.92 
 
 
70 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.987137  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3822  hypothetical protein  43.48 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00659964  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2271  hypothetical protein  34.29 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.941598  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2745  hypothetical protein  36.67 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1943  hypothetical protein  37.5 
 
 
94 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0543  hypothetical protein  37.5 
 
 
94 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1041  hypothetical protein  37.5 
 
 
94 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144032  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2639  hypothetical protein  46 
 
 
109 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1693  phage protein  46.81 
 
 
101 aa  41.2  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0612931 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>