26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_R0040 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_R0040  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000151754  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0021  tRNA-Arg  91.07 
 
 
73 bp  71.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191091  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0056  tRNA-Arg  88.33 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0030  tRNA-Pro  92.31 
 
 
77 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135671  decreased coverage  0.0000000375958 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tArg01  tRNA-Arg  88 
 
 
80 bp  52  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000810736  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2557  tRNA-Arg  84.93 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.55794e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0014  tRNA-Arg  82.89 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.951342 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0034  tRNA-Pro  93.75 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000537169  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0001  tRNA-Arg  82.89 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00219476  hitchhiker  0.0000103826 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0016  tRNA-Val  93.75 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000321371  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0010  tRNA-Pro  87.5 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0571351  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lplt08  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0051  tRNA-Arg  96.3 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0856263  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0086  tRNA-Arg  96.3 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt08  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0015  tRNA-Pro  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11205  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0010  tRNA-Pro  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0069  tRNA-Arg  91.18 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140989  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0034  tRNA-Pro  83.87 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000221471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0037  tRNA-Arg  85.19 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000548287  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0010  tRNA-Pro  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0068  tRNA-Pro  93.33 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.147043  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0041  tRNA-Arg  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0057  tRNA-Pro  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0007  tRNA-Pro  96.15 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.929508 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0042  tRNA-Arg  85.19 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00669255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>