11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3132 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3132  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  286  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.584475  normal  0.267195 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1849  hypothetical protein  27.41 
 
 		 250 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0827  hypothetical protein  28.47 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.348672  unclonable  0.00000936825 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5171  hypothetical protein  27.21 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.182508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3334  hypothetical protein  27.21 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0824  ankyrin  25 
 
 		 483 aa  50.8  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.224005  unclonable  0.0000134669 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1848  ankyrin  22.7 
 
 		 495 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2864  hypothetical protein  23.7 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1540  Limonene-12-epoxide hydrolase  29.46 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3153  hypothetical protein  24.69 
 
 		 286 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.285807  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6122  hypothetical protein  22.95 
 
 		 132 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.800704  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>