33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4558 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4560  WD-40 repeat protein  77.78 
 
 		 1116 aa  1506    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4558  WD-40 repeat protein  100 
 
 		 1125 aa  2191    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0393  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  39.47 
 
 		 641 aa  289  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5130  hypothetical protein  51.01 
 
 		 290 aa  268  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7647  hypothetical protein  44 
 
 		 311 aa  188  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3567  hypothetical protein  29 
 
 		 670 aa  95.9  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.929607  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4166  hypothetical protein  27.59 
 
 		 738 aa  66.6  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.530303  normal  0.0503721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.05 
 
 		 1557 aa  64.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1429  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  42.11 
 
 		 418 aa  63.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3984  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.4 
 
 		 605 aa  60.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.187514  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0996  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.77 
 
 		 1110 aa  58.2  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.399368  normal  0.160233 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.96 
 
 		 1240 aa  56.2  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  25.67 
 
 		 1328 aa  52.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  33.53 
 
 		 1217 aa  51.6  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.02 
 
 		 1609 aa  50.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5293  cytochrome c class I  29.25 
 
 		 426 aa  50.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325519  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2994  hypothetical protein  35.4 
 
 		 237 aa  49.7  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  32.45 
 
 		 1901 aa  49.3  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0563  hypothetical protein  24.15 
 
 		 346 aa  48.9  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4212  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  22.44 
 
 		 1234 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1763  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.01 
 
 		 1475 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.923912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6159  hypothetical protein  29.36 
 
 		 826 aa  48.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122824  decreased coverage  0.0000727182 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  24.06 
 
 		 1213 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  26.82 
 
 		 1807 aa  47.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  23.5 
 
 		 1878 aa  46.6  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  27.75 
 
 		 790 aa  46.2  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  23.63 
 
 		 1161 aa  45.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0781  WD-40 repeat protein  31.08 
 
 		 711 aa  45.4  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  23.63 
 
 		 1161 aa  45.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  26.61 
 
 		 1264 aa  45.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  26.61 
 
 		 1264 aa  45.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  30.34 
 
 		 1523 aa  45.1  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  24.07 
 
 		 1188 aa  45.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>