41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3648 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3648  protein of unknown function DUF820  100 
 
 
218 aa  449  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.288814  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3679  protein of unknown function DUF820  49.08 
 
 
239 aa  197  7.999999999999999e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8829  protein of unknown function DUF820  42.99 
 
 
225 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4246  protein of unknown function DUF820  31.47 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6498  hypothetical protein  30.23 
 
 
184 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.188707  normal  0.480601 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0193  protein of unknown function DUF820  33.76 
 
 
186 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3939  protein of unknown function DUF820  36.65 
 
 
202 aa  62  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.117459  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2128  hypothetical protein  30.23 
 
 
184 aa  61.6  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578066  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  31.61 
 
 
207 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  23.78 
 
 
193 aa  50.1  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  30.25 
 
 
202 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2224  hypothetical protein  31.85 
 
 
219 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108334  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  29.41 
 
 
192 aa  47.8  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2526  hypothetical protein  30.15 
 
 
203 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206589  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  31.87 
 
 
186 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8121  hypothetical protein  31.74 
 
 
182 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6884  hypothetical protein  29.71 
 
 
200 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3383  protein of unknown function DUF820  30.86 
 
 
187 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0149444  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  29.08 
 
 
191 aa  45.8  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  30 
 
 
201 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0726  hypothetical protein  25.54 
 
 
208 aa  45.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.225388  normal  0.518771 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  28.06 
 
 
183 aa  45.8  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1615  protein of unknown function DUF820  28.49 
 
 
197 aa  45.4  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.852341 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2863  protein of unknown function DUF820  26.4 
 
 
203 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000118606  decreased coverage  0.0000938837 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  28.46 
 
 
184 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  27.14 
 
 
182 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3258  protein of unknown function DUF820  26.4 
 
 
203 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  29.09 
 
 
203 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  23.83 
 
 
191 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  24.56 
 
 
257 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0557  hypothetical protein  27.33 
 
 
201 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140412  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  25.52 
 
 
227 aa  42.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2156  prevent-host-death family protein  23.15 
 
 
242 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7645  protein of unknown function DUF820  29.31 
 
 
198 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2260  hypothetical protein  29.93 
 
 
207 aa  42.4  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0612695  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4366  protein of unknown function DUF820  27.88 
 
 
194 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.353862 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  25.93 
 
 
180 aa  42.4  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4494  hypothetical protein  30.4 
 
 
159 aa  42  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  29.07 
 
 
204 aa  41.6  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  24.86 
 
 
241 aa  41.6  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  21.15 
 
 
190 aa  41.6  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>