16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3602 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3602  polysaccharide biosynthesis protein CelD  100 
 
 
363 aa  728    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317396  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7661  polysaccharide biosynthesis protein CelD  59.78 
 
 
363 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7654  cellulose biosynthesis protein CelD  51.67 
 
 
376 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3587  hypothetical protein  48.08 
 
 
363 aa  323  3e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1928  polysaccharide biosynthesis protein CelD  47.93 
 
 
364 aa  322  5e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411311  normal  0.123399 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1930  polysaccharide biosynthesis protein CelD  47.66 
 
 
360 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0135323  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1755  cellulose biosynthesis protein CelD  30.96 
 
 
359 aa  151  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189987  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0440  hypothetical protein  28.97 
 
 
372 aa  144  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.463768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0656  hypothetical protein  36.65 
 
 
349 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4871  hypothetical protein  30.06 
 
 
360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1683  cellulose biosynthetic (CelD)-like protein  28.85 
 
 
359 aa  127  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548843  normal  0.0452897 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2354  hypothetical protein  33.56 
 
 
381 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1351  hypothetical protein  30.22 
 
 
376 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0664  cellulose biosynthesis protein CelD  28.95 
 
 
326 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.250925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5467  hypothetical protein  27.8 
 
 
411 aa  43.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3792  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)  31.85 
 
 
331 aa  43.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>