17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3158 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3158  protein of unknown function DUF1396  100 
 
 
230 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0785355  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3012  hypothetical protein  43.11 
 
 
225 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218964  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1501  hypothetical protein  40.64 
 
 
218 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268016  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05600  Protein of unknown function (DUF1396)  36.82 
 
 
227 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07420  Protein of unknown function (DUF1396)  30.94 
 
 
234 aa  102  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0367  protein of unknown function DUF1396  26.78 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0720585  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3312  protein of unknown function DUF1396  29.06 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2435  hypothetical protein  27.27 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2429  hypothetical protein  27.27 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2388  hypothetical protein  27.27 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3724  hypothetical protein  28.02 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.0746496 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11440  lipoprotein lprG  23.77 
 
 
236 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2692  hypothetical protein  26.51 
 
 
234 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12959  lipoprotein lppX  25.56 
 
 
233 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200622  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2324  protein of unknown function DUF1396  23.94 
 
 
268 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11296  lipoprotein lprA  24.58 
 
 
244 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11399  lipoprotein lprF  23.81 
 
 
261 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>