29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3470 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3470  hypothetical protein  100 
 
 
61 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.599905  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9224  hypothetical protein  83.61 
 
 
61 aa  103  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4546  hypothetical protein  73.77 
 
 
61 aa  92.8  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2785  hypothetical protein  69.49 
 
 
61 aa  80.9  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.778108  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1816  hypothetical protein  62.71 
 
 
78 aa  69.3  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.707667  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2652  hypothetical protein  65.91 
 
 
67 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441179  normal  0.0488909 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2014  hypothetical protein  59.32 
 
 
82 aa  61.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2621  hypothetical protein  50.85 
 
 
72 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120603  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2252  hypothetical protein  50.85 
 
 
69 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.318577  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2164  hypothetical protein  55.93 
 
 
77 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0247439  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21020  hypothetical protein  54.24 
 
 
66 aa  57.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.606527 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1475  hypothetical protein  55.17 
 
 
67 aa  56.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.707242  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1907  hypothetical protein  50.85 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000016688 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16270  hypothetical protein  50.85 
 
 
92 aa  55.5  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.020473  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2654  hypothetical protein  50.98 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00923338  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4901  hypothetical protein  58.14 
 
 
67 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342241  normal  0.0633468 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11780  hypothetical protein  45.76 
 
 
79 aa  51.6  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.166169  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3527  hypothetical protein  49.02 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2656  hypothetical protein  48.08 
 
 
72 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2131  hypothetical protein  55.81 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.232195  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2315  hypothetical protein  44.23 
 
 
75 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.626905  hitchhiker  0.00521659 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2436  hypothetical protein  49.02 
 
 
93 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267631  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2771  hypothetical protein  47.06 
 
 
103 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00046183  hitchhiker  0.000158734 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3161  hypothetical protein  49.02 
 
 
83 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.738065  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3223  hypothetical protein  49.02 
 
 
83 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.245573  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20050  hypothetical protein  41.18 
 
 
75 aa  44.3  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.408374  hitchhiker  0.00194499 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3173  hypothetical protein  49.02 
 
 
83 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13860  hypothetical protein  58.97 
 
 
82 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000410267  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2161  hypothetical protein  42.86 
 
 
75 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>