25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2624 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2624  hypothetical protein  100 
 
 
412 aa  792    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.541634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3816  hypothetical protein  43.98 
 
 
229 aa  156  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4592  hypothetical protein  46.02 
 
 
201 aa  152  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08140  hypothetical protein  47.03 
 
 
216 aa  146  8.000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2128  hypothetical protein  42.08 
 
 
213 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.109674  normal  0.0130152 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2141  hypothetical protein  43.82 
 
 
213 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.686626  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2187  hypothetical protein  43.82 
 
 
213 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.220021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2543  hypothetical protein  45.25 
 
 
235 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.117071  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2412  hypothetical protein  43.24 
 
 
212 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.100604  normal  0.339775 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1944  hypothetical protein  43.28 
 
 
227 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2490  hypothetical protein  42.22 
 
 
232 aa  126  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3815  hypothetical protein  39.86 
 
 
186 aa  86.7  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473897  normal  0.0339082 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4593  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.76 
 
 
206 aa  79  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2542  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.25 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.364829 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08130  hypothetical protein  39.87 
 
 
172 aa  72.8  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  33.52 
 
 
289 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2413  NifU domain-containing protein  34.86 
 
 
297 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0708227  normal  0.256977 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2129  NifU domain-containing protein  37.06 
 
 
294 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0750308  normal  0.014165 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2491  hypothetical protein  37.2 
 
 
202 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98493  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2188  NifU domain-containing protein  36.36 
 
 
294 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.226918 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2142  nitrogen-fixing NifU-like protein  36.36 
 
 
294 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  29.49 
 
 
286 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.58 
 
 
285 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.010436 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  31.06 
 
 
291 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1943  nitrogen-fixing NifU-like  34.88 
 
 
191 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>