12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2466 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2466  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  555  1e-157  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.433684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0061  FRG domain protein  40.59 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2223  hypothetical protein  32.33 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4453  FRG domain-containing protein  24.7 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1407  hypothetical protein  25.9 
 
 		 277 aa  46.6  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000870046  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0436  FRG domain protein  30.91 
 
 		 265 aa  46.6  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0332  FRG domain-containing protein  60 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820546 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1726  FRG domain protein  26.98 
 
 		 380 aa  44.7  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.344355  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2922  hypothetical protein  23.88 
 
 		 261 aa  42.7  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3852  FRG domain protein  26.04 
 
 		 264 aa  42.7  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000680889 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0446  FRG domain-containing protein  45.45 
 
 		 519 aa  42.4  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0137329  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2511  FRG domain protein  50 
 
 		 262 aa  42.7  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.674893 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>