18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1762 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1762  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  589  1e-167  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1705  alpha/beta hydrolase fold  90.88 
 
 
285 aa  548  1e-155  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0215  hypothetical protein  49.82 
 
 
316 aa  295  8e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1641  hypothetical protein  48.39 
 
 
306 aa  290  3e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1426  hypothetical protein  45.36 
 
 
302 aa  258  6e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0485353  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1343  hypothetical protein  30.18 
 
 
329 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.696789  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1047  hypothetical protein  28.82 
 
 
335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0248  hypothetical protein  26.33 
 
 
337 aa  102  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.386374  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1656  hypothetical protein  25 
 
 
314 aa  93.6  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1590  hypothetical protein  24.83 
 
 
316 aa  94  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0006  YdjC  29.2 
 
 
332 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.925348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4523  hypothetical protein  25.69 
 
 
313 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2069  lysophospholipase-like protein  27.5 
 
 
380 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2417  hypothetical protein  27.03 
 
 
333 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0134  hypothetical protein  26.26 
 
 
323 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2740  YdjC  26.56 
 
 
333 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2557  YdjC  26.13 
 
 
333 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129817 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1830  alpha/beta hydrolase  30.67 
 
 
270 aa  42.7  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>