12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0120 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0122  O-antigen polymerase  95.96 
 
 
1065 aa  2086    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0446  O-antigen polymerase  39.76 
 
 
1070 aa  736    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0515  O-antigen polymerase  36.92 
 
 
1090 aa  688    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0340666  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0120  O-antigen polymerase  100 
 
 
1065 aa  2160    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0198  O-antigen polymerase  30.19 
 
 
874 aa  340  9.999999999999999e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1186  Tetratricopeptide domain protein  25 
 
 
829 aa  64.3  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0301041  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  24.86 
 
 
612 aa  59.3  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  22.15 
 
 
773 aa  52  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2694  O-antigen polymerase  26.47 
 
 
535 aa  48.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.247958  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  26.56 
 
 
437 aa  47  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  21.28 
 
 
870 aa  45.4  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  23.55 
 
 
754 aa  44.7  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>