228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2798 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2798  arsenate reductase and related  100 
 
 		 127 aa  258  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.762473 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2102  arsenate reductase  57.76 
 
 		 140 aa  144  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.250849  normal  0.414942 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0605  arsenate reductase and related  57.76 
 
 		 140 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.756451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0590  arsenate reductase and related  57.76 
 
 		 140 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3127  putative arsenate reductase  59.65 
 
 		 143 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1785  arsenate reductase  54.39 
 
 		 141 aa  123  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0225096 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3857  arsenate reductase  58.77 
 
 		 143 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3135  arsenate reductase  53.04 
 
 		 141 aa  120  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.743459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  53.04 
 
 		 317 aa  120  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3199  arsenate reductase  48.76 
 
 		 141 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2539  arsenate reductase  48.76 
 
 		 143 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.220394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2271  arsenate reductase  56.64 
 
 		 114 aa  118  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.490567 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0876  arsenate reductase  50.43 
 
 		 145 aa  117  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0215  arsenate reductase  51.3 
 
 		 142 aa  117  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3418  arsenate reductase  47.93 
 
 		 141 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.884479 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3125  arsenate reductase  47.97 
 
 		 141 aa  115  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0302  arsenate reductase  49.57 
 
 		 140 aa  114  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0336269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2243  arsenate reductase  50.43 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.565091 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2534  arsenate reductase  52.17 
 
 		 121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0617  arsenate reductase  51.3 
 
 		 142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1910  arsenate reductase  47.93 
 
 		 141 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2461  arsenate reductase  43.7 
 
 		 143 aa  113  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.255465  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4257  arsenate reductase  45.45 
 
 		 141 aa  113  8.999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.339282 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7178  arsenate reductase  47.54 
 
 		 140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4852  arsenate reductase  46.49 
 
 		 141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03352  arsenate reductase  46.49 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0211  arsenate reductase  46.49 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3818  arsenate reductase  46.49 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3795  arsenate reductase  44.63 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256132 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0213  arsenate reductase  46.49 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.592565 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0324  arsenate reductase  47.93 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2198  arsenate reductase  46.15 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.580845  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3705  arsenate reductase  46.49 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.556229  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03305  hypothetical protein  46.49 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4053  arsenate reductase  47.93 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5055  arsenate reductase  45.97 
 
 		 143 aa  111  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1977  arsenate reductase  46.96 
 
 		 139 aa  111  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.224843  normal  0.139506 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3986  arsenate reductase  46.49 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1992  arsenate reductase  47.83 
 
 		 139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2812  arsenate reductase  44.26 
 
 		 140 aa  110  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4201  arsenate reductase  47.83 
 
 		 138 aa  110  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1048  arsenate reductase  47.93 
 
 		 141 aa  110  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0521  arsenate reductase  48.76 
 
 		 141 aa  110  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5723  arsenate reductase  47.11 
 
 		 141 aa  110  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1525  arsenate reductase  45.08 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.085223  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4429  arsenate reductase  45.22 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0329  arsenate reductase  45.08 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.705444 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5683  arsenate reductase  47.11 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2404  arsenate reductase  49.12 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.118806  normal  0.0241288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3865  arsenate reductase  47.46 
 
 		 145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.335288 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2161  arsenate reductase  45.22 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.757721  normal  0.741171 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1379  arsenate reductase  47.83 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0683447 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4174  arsenate reductase  47.06 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181376  normal  0.554285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4662  arsenate reductase  46.55 
 
 		 134 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.246432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00627  arsenate reductase  44.83 
 
 		 137 aa  107  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.205854  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1961  arsenate reductase  45.76 
 
 		 148 aa  107  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.182996  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1971  arsenate reductase  43.8 
 
 		 146 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0718  arsenate reductase  43.86 
 
 		 141 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0377236 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4072  arsenate reductase  50.41 
 
 		 141 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124746  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6066  arsenate reductase  44.26 
 
 		 140 aa  106  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5710  arsenate reductase  47.37 
 
 		 140 aa  105  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2389  arsenate reductase  42.98 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3114  arsenate reductase  41.53 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1542  arsenate reductase  48.7 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.261774  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30670  arsenate reductase  46.02 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0102  arsenate reductase  46.28 
 
 		 141 aa  105  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6300  arsenate reductase  46.49 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.743402  normal  0.39419 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0696  arsenate reductase  47.83 
 
 		 145 aa  103  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.739002 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2418  arsenate reductase  40.98 
 
 		 142 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309899 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0957  arsenate reductase  43.48 
 
 		 115 aa  102  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0647  arsenate reductase  46.9 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_004310  BR0989  arsenate reductase ArsC, putative  43.48 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2345  arsenate reductase  43.33 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0221987  hitchhiker  0.00279499 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3830  arsenate reductase  43.33 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.720829  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2343  arsenate reductase  45.13 
 
 		 276 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1913  arsenate reductase  46.96 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02434  arsenate reductase  46.96 
 
 		 162 aa  100  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.94591  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6564  arsenate reductase  45.13 
 
 		 140 aa  100  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2219  arsenate reductase  42.48 
 
 		 143 aa  99.4  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3966  arsenate reductase  44.92 
 
 		 144 aa  98.6  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.662339 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2315  arsenate reductase  47.79 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.509444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5671  arsenate reductase  44.74 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1283  arsenate reductase  46.9 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.884735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2244  arsenate reductase  44.83 
 
 		 132 aa  97.8  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.134877  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1214  arsenate reductase  43.36 
 
 		 151 aa  97.8  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2652  arsenate reductase  42.61 
 
 		 113 aa  97.8  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.569962  normal  0.394172 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1465  arsenate reductase  41.03 
 
 		 134 aa  97.4  6e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0953  putative arsenate reductase  42.61 
 
 		 136 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0491  arsenate reductase  44.25 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0674  arsenate reductase  38.26 
 
 		 152 aa  93.6  8e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.587242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2288  arsenate reductase  43.33 
 
 		 143 aa  93.2  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.402748  hitchhiker  0.00391371 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0915  arsenate reductase  45.22 
 
 		 125 aa  93.6  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435432 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3196  arsenate reductase  41.74 
 
 		 113 aa  92.8  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0286  arsenate reductase  40.87 
 
 		 116 aa  92.8  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2520  arsenate reductase  39.13 
 
 		 116 aa  92.8  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782751  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0900  arsenate reductase  42.48 
 
 		 117 aa  92.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000694318 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2586  arsenate reductase  39.82 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.399241  normal  0.117903 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1745  arsenate reductase  38.79 
 
 		 116 aa  90.5  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002787  arsenate reductase  38.79 
 
 		 116 aa  90.5  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1181  arsenate reductase  38.52 
 
 		 135 aa  89.7  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>