16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1902 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1902  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  579  1e-164  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1651  hypothetical protein  36.93 
 
 		 268 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00915385 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44522  predicted protein  34.41 
 
 		 352 aa  161  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.431246  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1635  hypothetical protein  35.11 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0464556 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2547  proline hydroxylase-like protein  34.1 
 
 		 277 aa  135  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.259291 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3876  hypothetical protein  35.54 
 
 		 309 aa  133  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.31832  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0773  hypothetical protein  33.33 
 
 		 278 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0640  hypothetical protein  41.4 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3077  hypothetical protein  34.01 
 
 		 273 aa  115  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3313  hypothetical protein  33.5 
 
 		 273 aa  115  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106012  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5183  proline hydroxylase-like protein  33.77 
 
 		 323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000154624 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3002  hypothetical protein  32.78 
 
 		 203 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5796  hypothetical protein  31.85 
 
 		 285 aa  95.9  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0059  hypothetical protein  25.76 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.382992  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12896  GrpE protein, HSP90 cofactor, chloroplast targeted  25.11 
 
 		 525 aa  53.1  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0255  2OG-Fe(II) oxygenase  29.41 
 
 		 251 aa  42.4  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.791217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>