43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1088 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1088  protein of unknown function DUF1538  100 
 
 		 506 aa  977    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0659  hypothetical protein  72.36 
 
 		 503 aa  649    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201808 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3466  hypothetical protein  69.47 
 
 		 495 aa  648    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0802  protein of unknown function DUF1538  70.2 
 
 		 503 aa  617  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0800  protein of unknown function DUF1538  46.72 
 
 		 497 aa  363  6e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1498  hypothetical protein  52.69 
 
 		 262 aa  244  3e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.660987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2272  hypothetical protein  53.39 
 
 		 255 aa  242  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000140028  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0165  membrane protein  54.47 
 
 		 261 aa  241  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1592  hypothetical protein  52.78 
 
 		 261 aa  241  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1827  hypothetical protein  52.61 
 
 		 261 aa  240  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.149521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2761  hypothetical protein  50.8 
 
 		 263 aa  238  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.0518932 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1221  ABC transporter for copper permease protein  54.22 
 
 		 264 aa  234  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.121957 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1952  hypothetical protein  48.81 
 
 		 278 aa  229  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3685  hypothetical protein  48.63 
 
 		 269 aa  218  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2762  hypothetical protein  48.54 
 
 		 244 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  normal  0.055304 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1591  hypothetical protein  46.91 
 
 		 244 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1826  hypothetical protein  47.54 
 
 		 244 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.299788  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1953  hypothetical protein  47.68 
 
 		 245 aa  212  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1497  hypothetical protein  47.11 
 
 		 244 aa  211  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1220  hypothetical protein  50.44 
 
 		 244 aa  210  6e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.210254 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2271  hypothetical protein  47.68 
 
 		 245 aa  209  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00372269  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0017  hypothetical protein  30.29 
 
 		 620 aa  196  7e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000261883  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3684  hypothetical protein  50.85 
 
 		 248 aa  196  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2615  hypothetical protein  27.75 
 
 		 508 aa  194  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0107308  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0101  hypothetical protein  29.47 
 
 		 601 aa  194  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0908  protein of unknown function DUF1538  28.48 
 
 		 507 aa  187  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0164  membrane protein  49.56 
 
 		 244 aa  187  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.634614  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1143  protein of unknown function DUF1538  25.69 
 
 		 497 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150487  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1786  protein of unknown function DUF1538  30.45 
 
 		 545 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0836999  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3479  hypothetical protein  42.92 
 
 		 245 aa  169  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405509 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0323  hypothetical protein  27.54 
 
 		 481 aa  163  5.0000000000000005e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0750362  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0745  hypothetical protein  38.89 
 
 		 231 aa  152  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189103  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3139  membrane spanning protein  39.73 
 
 		 242 aa  145  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3478  hypothetical protein  36.08 
 
 		 255 aa  143  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611874 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0474  hypothetical protein  38.89 
 
 		 245 aa  143  9e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0746  hypothetical protein  38.43 
 
 		 243 aa  140  6e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0127316  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0341  protein of unknown function DUF1538  37.26 
 
 		 230 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766414 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0342  protein of unknown function DUF1538  34.68 
 
 		 253 aa  136  9e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510639 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0338  hypothetical protein  32.41 
 
 		 246 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322383  normal  0.567105 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0475  hypothetical protein  36.49 
 
 		 230 aa  125  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0337  hypothetical protein  31.72 
 
 		 232 aa  124  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0876004  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2378  hypothetical protein  27.72 
 
 		 646 aa  106  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1723  protein of unknown function DUF1538  30.88 
 
 		 288 aa  89.4  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>