17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0641 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0641  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 392 aa  811    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.071148 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2207  radical SAM domain protein  77.28 
 
 		 407 aa  613  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2546  radical SAM domain protein  57.14 
 
 		 377 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2174  Radical SAM domain protein  57.14 
 
 		 373 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1071  Radical SAM domain protein  38.58 
 
 		 332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000639337  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1054  Radical SAM domain protein  38.59 
 
 		 323 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.910454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0446  radical SAM family protein  35.47 
 
 		 325 aa  179  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1559  radical SAM domain-containing protein  30.23 
 
 		 299 aa  169  6e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0415302 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2087  Radical SAM domain protein  30.33 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1519  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.08 
 
 		 267 aa  125  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0647  Radical SAM domain protein  28.36 
 
 		 279 aa  119  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1948  radical SAM domain-containing protein  26.3 
 
 		 288 aa  110  6e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0920  radical SAM domain-containing protein  26.5 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0171174  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0942  radical SAM domain-containing protein  26.07 
 
 		 249 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1507  radical SAM domain-containing protein  25.18 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1700  radical SAM domain-containing protein  24.89 
 
 		 252 aa  78.6  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1142  biotin synthetase-like protein  19.32 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.918331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>