34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE_tRNA-Glu-2 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE_tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0059  tRNA-Glu  92.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0565727 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0034  tRNA-Glu  91.07 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00125127  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4586  tRNA-Glu  87.69 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388056  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4587  tRNA-Glu  87.69 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346053  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4588  tRNA-Glu  87.69 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607169  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0031  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0024  tRNA-Glu  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.228952 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0024  tRNA-Glu  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt39  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0049  tRNA-Glu  84.29 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0819027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0050  tRNA-Glu  84.29 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0023  tRNA-Glu  84.62 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0025  tRNA-Glu  84.62 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.328382 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0005  tRNA-Glu  84.62 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913112  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0025  tRNA-Glu  84.62 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0023  tRNA-Glu  84.62 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0003  tRNA-Glu  84.62 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0015  tRNA-Glu  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00812602 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0003  tRNA-Glu  84.62 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0040  tRNA-Glu  84.62 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.6497  hitchhiker  0.000739711 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0033  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0027  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_002950  PGt38  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0024  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA19  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.393669 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0034  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180899  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0039  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0038  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0041  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0015  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0015  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0011  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000477421 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0050  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>