13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2729 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2729  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  450  1e-125  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000838492  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3510  YhhN family protein  35.16 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5627  YhhN family protein  34.18 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1146  membrane protein, YhhN-like  33.12 
 
 		 246 aa  49.3  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0652127  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4525  YhhN family protein  34.55 
 
 		 223 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288194 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4067  YhhN family protein  43.24 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608466  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3695  YhhN-like  34.18 
 
 		 246 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4673  YhhN family protein  34.18 
 
 		 246 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.371542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3891  hypothetical protein  26.92 
 
 		 214 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4020  YhhN family protein  43.24 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.65035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3690  YhhN family protein  29.03 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0951  YhhN family protein  32.29 
 
 		 232 aa  42  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2193  YhhN family protein  27.52 
 
 		 234 aa  41.6  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>