20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0722 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0722  putative lipoprotein  100 
 
 
421 aa  850    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0474346  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0715  hypothetical protein  61.36 
 
 
447 aa  461  1e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000903644  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0723  hypothetical protein  44.22 
 
 
425 aa  313  4.999999999999999e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.182776  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0969  hypothetical protein  43.47 
 
 
411 aa  311  2e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0724  hypothetical protein  36.62 
 
 
434 aa  216  5.9999999999999996e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.754516  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2481  peptidase S41  35.11 
 
 
406 aa  94.4  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2480  peptidase S41  32.91 
 
 
413 aa  94.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0745  peptidase S41  26.98 
 
 
435 aa  79  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0187  peptidase S41  27.83 
 
 
466 aa  63.2  0.000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  23.94 
 
 
479 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1308  carboxyl-terminal protease  28.71 
 
 
490 aa  46.2  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  25.29 
 
 
479 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  27.59 
 
 
478 aa  45.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  24.43 
 
 
478 aa  44.3  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  18.78 
 
 
437 aa  44.7  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  24.28 
 
 
481 aa  44.3  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 
418 aa  43.9  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  27.56 
 
 
478 aa  43.9  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  26.77 
 
 
478 aa  43.5  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  22.01 
 
 
480 aa  43.5  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>