24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12938 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12938  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  272  9e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0241589  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4190  OsmC family protein  72.99 
 
 
163 aa  211  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.708913  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2173  OsmC family protein  72.59 
 
 
141 aa  210  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1951  OsmC-like protein  72.06 
 
 
141 aa  208  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.466899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1997  OsmC family protein  72.06 
 
 
141 aa  208  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.608934  normal  0.376979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1931  OsmC family protein  72.06 
 
 
141 aa  207  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110591  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1570  OsmC family protein  70.99 
 
 
145 aa  194  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00295172  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2074  OsmC family protein  69.47 
 
 
153 aa  191  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12637  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30670  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  63.64 
 
 
171 aa  174  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0784  OsmC family protein  56.49 
 
 
154 aa  153  6e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2839  OsmC family protein  50.79 
 
 
164 aa  137  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23594  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1983  OsmC family protein  46.56 
 
 
146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2855  OsmC family protein  44.78 
 
 
158 aa  112  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0710  OsmC family protein  41.22 
 
 
154 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16800  OsmC-like protein  41.54 
 
 
154 aa  99  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0440531  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1788  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0403  OsmC-like protein  29.85 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8006  OsmC family protein  29.55 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7915  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  34.85 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1018  OsmC family protein  35.77 
 
 
142 aa  53.9  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20740  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  30.3 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104919  normal  0.0981692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2694  OsmC family protein  30.08 
 
 
130 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0448513  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2692  OsmC family protein  28.26 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0751564  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14900  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  27.21 
 
 
152 aa  40.4  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0136594  normal  0.328629 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>