33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12006 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12006  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  449  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000525757  normal  0.57612 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0567  hypothetical protein  71.83 
 
 
196 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0523  hypothetical protein  71.83 
 
 
197 aa  218  6e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.811296  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3825  hypothetical protein  70.92 
 
 
161 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392195  normal  0.731679 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1749  hypothetical protein  71.13 
 
 
197 aa  214  7e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20721  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1683  hypothetical protein  71.13 
 
 
197 aa  214  7e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.23601  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1733  hypothetical protein  71.13 
 
 
197 aa  214  7e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1705  hypothetical protein  71.13 
 
 
197 aa  214  7e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1556  hypothetical protein  73.68 
 
 
166 aa  211  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.643562  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1533  hypothetical protein  73.68 
 
 
166 aa  211  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.209427  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2711  hypothetical protein  70.45 
 
 
162 aa  201  8e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  0.533265 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4106  hypothetical protein  61.81 
 
 
168 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123266  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0917  hypothetical protein  63.4 
 
 
172 aa  186  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  35.77 
 
 
465 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  32.08 
 
 
212 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0720  hypothetical protein  81.48 
 
 
36 aa  52  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.15 
 
 
444 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0125  hypothetical protein  81.48 
 
 
36 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  34.15 
 
 
458 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.91 
 
 
213 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.97 
 
 
443 aa  49.7  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  30.83 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1399  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.57 
 
 
156 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  32.35 
 
 
495 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0097  hypothetical protein  70.37 
 
 
42 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.830884  normal  0.324824 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0116  hypothetical protein  70.37 
 
 
42 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0738139 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0107  hypothetical protein  70.37 
 
 
42 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0901406  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  29.82 
 
 
287 aa  45.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  32.29 
 
 
168 aa  43.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  32.29 
 
 
209 aa  42.4  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  28.7 
 
 
264 aa  42.7  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  27.35 
 
 
305 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  30.25 
 
 
260 aa  42  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>