37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1233 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1233  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  442  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0271776 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0517  Ion transport 2 domain protein  34.08 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000756398  decreased coverage  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0500  Ion transport 2 domain protein  34.08 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0413  Ion transport 2 domain-containing protein  35.23 
 
 		 238 aa  97.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3632  Ion transport 2 domain protein  43.48 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.070187  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2411  Ion transport 2 domain protein  37.88 
 
 		 271 aa  85.1  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.403469  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2018  Ion transport 2 domain protein  41.82 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2482  Ion transport 2 domain protein  35.96 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.745368  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4607  hypothetical protein  36.84 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2231  Ion transport 2 domain protein  34.96 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338612 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1459  Ion transport 2 domain-containing protein  36.89 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209929 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0647  ion transport family protein  32.76 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1907  putative ion channel  37.07 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1842  Ion transport 2 domain-containing protein  35.65 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5186  putative Voltage-gated potassium channel  32.2 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.240486 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4778  hypothetical protein  33.64 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248369  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1772  Ion transport 2 domain-containing protein  30.97 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06642  Kef-type K+ transport system NAD-binding component  28.99 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1808  Ion transport 2 domain-containing protein  35.19 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0516361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0255  ion transport 2 domain-containing protein  32.32 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106172 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001142  potassium channel protein  31.43 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54680  hypothetical protein  33.66 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238288  hitchhiker  0.00000298461 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2859  Ion transport 2 domain protein  28.12 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0749  Ion transport 2 domain protein  30 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19221  hypothetical protein  31.39 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.774034 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3734  hypothetical protein  29.08 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.724435 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1485  hypothetical protein  25.56 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22810  hypothetical protein  30.56 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0923  hypothetical protein  25.76 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.581577 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0760  Ion transport 2 domain protein  28.97 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400355  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1372  Ion transport 2 domain-containing protein  39.29 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1489  Ion transport 2 domain protein  26.32 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670111  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  43.59 
 
 		 302 aa  43.5  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  35.94 
 
 		 277 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  38.33 
 
 		 288 aa  42.4  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1320  Ion transport 2 domain protein  41.27 
 
 		 290 aa  42.4  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.615592  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4283  Ion transport protein  25.83 
 
 		 285 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0210487  normal  0.0226615 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>